Houston, Jan. 18, 2022 (GLOBE NEWSWIRE) — NuProbe, ein Genomik- und Molekulardiagnostikunternehmen, das hochempfindliche Assays für die Präzisionsforschung in der Onkologie entwickelt, hat veröffentlicht forschen demonstriert heute eine neue Technologie zum qualitativen und quantitativen Nachweis mehrerer niederfrequenter Varianten in einer quantitativen PCR (qPCR)-Reaktion. Die neue Allel-spezifische BDA (As-BDA)-Technologie verwendet qPCR, um Mutationen bis zu 0,01 % Variant Allele Fraction (VAF) in 2 Stunden nachzuweisen.
Blocker Displacement Amplification (BDA), eine der Kerntechnologien von NuProbe, entfernt Wildtyp-Sequenzen aus der Bibliothek und reichert seltene Varianten selektiv an, wodurch eine Nachweisgrenze (LoD) von 0,1 % VAF in PCR und gemultiplextem Echtzeit-NGS erreicht wird. Mit Standard-BDA und Echtzeit-PCR können Mutationen in der Blocker-Anreicherungsregion mit mehr Reaktionen oder einer anderen Sequenzierungstechnologie wie der Sanger-Sequenzierung identifiziert werden. As-BDA verstärkt BDA, indem spezifische Mutationen innerhalb einer Probe bei einer verbesserten Nachweisgrenze genau gemeldet werden.
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„As-BDA überwindet die Einschränkungen aktueller Technologien wie NGS und tröpfchenbasierter digitaler PCR in Bezug auf Empfindlichkeit, Multiplexität und Einfachheit des Arbeitsablaufs“, sagte Kerou Zhang, beratender Wissenschaftler und erster Forschungsautor von NuProbe. „As-BDA identifiziert Varianten mit hoher Sensitivität und Spezifität, was es vorteilhaft und potenziell für die nicht-invasive Mutationsprofilierung mit Flüssigbiopsie zur Krebsdiagnose und -überwachung macht, wo die VAF-Mutation normalerweise sehr schwach ist.“
Es wurden Studien mit einem Dreiröhrchen-IDH2-Test und einer Einzelröhrchenanalyse von IDH2 R140Q durchgeführt. Beim Dreiröhrchen-Assay detektierte jedes Röhrchen bis zu 4 Mutationen gleichzeitig mit VAF von nur 0,1 % unter Verwendung von 15 ng DNA-Input. Die Wissenschaftler führten auch Vergleichsstudien mit ddPCR für die R140Q-Mutation unter Verwendung von DNA peripherer mononukleärer Blutzellen (PMBC) aus 11 klinischen Proben von akuter myeloischer Leukämie (AML), 7 Proben von gesunden Spendern und Referenzproben durch. As-BDA-Ergebnisse stimmten zu 100 % mit ddPCR für Mutationen bei VAF von nur 0,1 % überein.
„Wir sind begeistert von dieser neuen Technologie, die einen gleichzeitigen qualitativen und quantitativen Mutationsnachweis mit einer schnellen Bearbeitungszeit bieten kann“, sagte David Zhang, CEO von NuProbe und korrespondierender Autor der Studie. „Wenn diese Technologie in die Molekulardiagnostik und die Genomforschung übertragen wird, hat sie das Potenzial, die klinische Sensitivität mit schneller Umsetzung zu verbessern.“
Über NuProbe
NuProbe ist ein führendes Genomik- und Molekulardiagnostikunternehmen mit bahnbrechenden Molekulardiagnostiktechnologien, um die Empfindlichkeit der Sequenzierung von Mutationen und Variationen der Kopienzahl um mehr als das Zehnfache zu verbessern. NuProbe hat Standorte in Houston, USA, Shanghai, China und Suzhou, China. Die Vision von NuProbe ist es, erschwingliche, zeitnahe und genaue Informationen zum Krankheitsstatus bereitzustellen, um eine Präzisionsmedizin zu ermöglichen und die Behandlungsergebnisse für Patienten zu verbessern.
Die Produkte von NuProbe sind nur für Forschungszwecke bestimmt und nicht für die In-vitro-Diagnostik.
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